Spesso si pensa che la storia degli Stati Uniti sia iniziata nel XVI secolo, ma in realtà queste terre sono state abitate per decine di migliaia di anni. A Mesa Verde sono state trovate tracce lasciate dagli indiani Pueblo oltre 1400 anni fa.
I primi resti di abitazioni sono le pithouse, letteralmente "case a buca", scavate nel terreno nel 600. Gli indiani Pueblo costruivano queste case in modo tale da poterle utilizzare come rifugio. Gli indiani Pueblo costruirono queste abitazioni con ossa, pietre e legno. All'epoca, circa 5.000 di loro vivevano a Mesa Verde e fino a tre generazioni vivevano sotto lo stesso tetto.