Flybe propone più modi per registrarsi. Si può effettuare il check-in online direttamente sul sito Flybe.com oppure recarsi direttamente al desk di registrazione presso l'aeroporto o fare il check-in presso uno dei terminal automatici che si trovano sul posto. Sono tutte soluzioni pratiche per evitare le file interminabili. I passeggeri devono presentarsi al Gate al massimo 30 minuti prima della partenza del volo.
Il numero di bagagli in stiva e in cabina varia a seconda della classe prenotata. La formula Essential permette di portare gratuitamente un bagaglio di massimo 10 kg in cabina ma nessun bagaglio in stiva. La formula New Economy permette di trasportare un bagaglio in cabina e un altro in stiva. Questo dovrà pesare al massimo 20 kg. Al fine di conoscere tutte le politiche dei bagagli con la compagnia Flybe sarebbe opportuno far riferimento al sito http://fr.flybe.com/. Per quanto riguarda la franchigia del bagaglio a mano, le dimensioni non devono superare 55x40x23 cm. Attenzione, per la classe Economy tutte le opzioni per i bagagli sono a pagamento. Bisognerà specificare questa opzione al momento della prenotazione del volo. Solo per la Prima Classe il servizio è gratuito.