Si contano circa 600 specie vegetali, a cominciare dal merbau, l'albero ufficiale dell'isola, utilizzato, tra l'altro, per fabbricare mobili e sculture. Guam è anche conosciuta per gli sfavillanti fiori delle buganville e per il profumo dei frangipani e del gelsomino. Gli alberi da frutta sono numerosi: papaie, banane, noci di cocco, frutti dell'albero del pane, manghi, guaiave, limette... Vi sono tre giardini botanici: Inarajan a sud, Nano Fall nel pittoresco villaggio di Santa Rita, e la piantagione di ananas a Yigo.